Estudio de la microbiota salival humana en pacientes con cáncer epidermoide de laringe
- Lara Lozano, Juan David
- Diego Hellín Meseguer Director
- V. Navarro López Director/a
Universitat de defensa: Universidad de Murcia
Fecha de defensa: 10 de de novembre de 2023
- Jose Luis Llorente Pendás President/a
- Pedro Sánchez Pellicer Secretari/ària
- Alfonso Capitán Guarnizo Vocal
Tipus: Tesi
Resum
INTRODUCCIÓN El cáncer de laringe es la séptima tumoración maligna más frecuente, con una creciente incidencia y prevalencia del 12% y 23,8%, respectivamente, en las últimas décadas. El diagnóstico inicial del cáncer de laringe se realiza con historia clínica y exploración física a través de la valoración oral directa, exploración cervical y la nasofibrolaringoscopia. Es importante la asociación con pruebas radiológicas como la PAAF de adenopatías cervicales, la tomografía computarizada, resonancia magnética, entre otras, para definir la extensión del tumor. El diagnóstico definitivo se realiza a través de anatomía patológica, siendo la estirpe más frecuente, el carcinoma epidermoide. El tratamiento debe ser individualizado a las características de cada patología y del paciente. Dentro de las posibilidades se encuentran cirugía abierta, cirugía transoral y conservación de órgano con radioterapia y quimioterapia. La microbiota humana se define como la agrupación de microoganismos constituidos por bacterias, virus y demás eucariotas que se pueden comportar como un órgano funcional y coexiste con el individuo. La relación entre la microbiota y el cáncer no está clara y aún está por definir. Algunos estudios recientes han demostrado que los microorganismos juegan un papel importante en la carcinogénesis, así como la genética y los factores ambientales. Existe algunos estudios donde se relaciona el cáncer de orofaringe, faringe o laringe con una microbiota característica y con la disbiosis de esta. OBJETIVOS El objetivo de nuestro estudio es definir la microbiota salival de pacientes con cáncer epidermoide de laringe y establecer las diferencias entre estos y un grupo de pacientes con patología benigna de laringe. De esta manera de puede ayudar a definir los microorganismos relacionados con este tipo de cáncer y su posible origen. Por otra parte, estos microoganismos podrían servir como biomarcador para el diagnóstico precoz de la enfermedad. MATERIALES Y MÉTODOS Se describe un estudio de casos y controles con una muestra de 40 pacientes provenientes de la población del Área I de salud del Hospital Virgen de la Arrixaca de Murcia con diagnóstico histopatológico de carcinoma epidermoide de laringe como grupo de casos y pacientes con patología benigna de laringe como grupo control. Mediante secuenciación masiva del gen bacteriano ARNr 16S se realizaron estudios de alfa y beta diversidad, mediante índices estadísticos basados en la ecología bacteriana y mediante curvas de rarefacción y de composición mediante el estudio de las abundancias relativas a nivel de familia y género. Se valoraron las diferencias estadísticamente significativas entre los dos grupos mediante la prueba no paramétrica de Wilcoxon. Así mismo, se realizaron estudios de agrupamiento mediante análisis principal de componentes y modelo UniFrac. Por último, se definió el área bajo la curva de 3 bacterias estadísticamente significativas, así como también, el punto de Youden. RESULTADOS Se encontró una similitud en cuanto a la edad y género entro los dos grupos de estudio. En cuanto al rango taxonómico familia se evidencia una disminución de la diversidad de familias bacterianas en el microbiota salival de los casos, con predominancia significativa de la familia Micrococcaceae, Familia XIII, Campylobacteraceae y Peptostreptococcaceae. También se muestra de forma estadísticamente significativa que existe un aumento en los casos comparado con los controles en la familia Micrococcaceae, Family XI, Xanthobacteraceae y Pasteurellaceae. Por el contrario, existe una disminución estadísticamente significativa de los casos comparados con los controles en las familias Bacteroidales Incertae Sedis, Porphyromonadaceae, Flavobacteriaceae, Prevotellaceae, entre otras. En cuanto a rango taxonómico género se encontró una alta abundancia relativa de Rothia, Campylobacter, Parvimonas, Eubacterium nodatum group, Alloprevotella y Croynebacterium. Se evidencia una disminución de la diversidad de los géneros bacterianos del grupo de casos comparado con los controles, principalmente a expensas de Rothia y Corinebacterium. En comparación con los controles, en los casos de nuestro estudio aumentaron significativamente los géneros de Corynebacterium, Rothia y Gemella. Así mismo, se muestra una disminución en los casos de los géneros Porphyromonas, Alloprevotella, Prevotella, Prevotella 7, Campylobacter, Defluviitaleaceae, Parvimonas, entre otras. Se evidencia una pérdida de alfa diversidad y riqueza en el grupo de casos con cáncer epidermoide de laringe con respecto al grupo de controles. Los estimadores de riqueza CHAO1 y ACE presentan una diferencia estadísticamente significativa que refleja. A través de las curvas de rarefacción se muestra que el grupo de controles presenta una riqueza mayor que el grupo de casos. La beta diversidad fue definida por el índice de Jaccard, que se aprecia bajo para ambos grupos. El PCoA mostró gráficamente que existe una mayor cantidad de muestras juntas en ambos grupos de estudio. Se realizó las curvas ROC y el área bajo la curva de los tres géneros Alloprevotella, Campylobacter y Rothia donde se definieron puntos de Youden con la mayo especificidad posible, dado la patología con la que tratamos. Todos las curvas se encontraron por encima del 0,75, mostrando una buena discriminación media. CONCLUSIONES Concluimos que el grupo de pacientes con carcinoma epidermoide de laringe tienen una microbiota salival que es completamente diferente en diversidad, riqueza, estructura y composición a la de los controles. De igual manera se definieron 3 géneros específicos con una alta especificidad y sensibilidad a la hora de desarrollar un biomarcador para el diagnóstico precoz de la enfermedad.