Estudio conformacional y dinamico de macromoleculas flexibles

Resumen

EL ADN DE PESO MOLECULAR INTERMEDIO ES UN EJEMPLO TIPICO DE MACROMOLECULA PARCIALMENTE FLEXIBLE O SEMIFLEXIBLE . LA FLEXIBILIDAD DE ESTA MACROMOLECULA HASIDO ESTUDIADA POR VARIOS AUTORES. EXISTEN DOS IDEAS DIFERENTES RESPECTO A ESTA FLEXIBILIDAD. UNA DE ELLAS CONSISTE EN CONSIDERAR LA FLEXIBILIDAD A LO LARGO DE TODA LA CADENA Y LA OTRA SUPONE QUE LA MACROMOLECULA POSEE UNAS LLAMADAS JUNTAS DE ARTICULACION QUE ES POR DONDE UNICAMENTE LA MACROMOLECULA PUEDE DOBLARSE O FLEXIONARSE. EL OBJETIVO DE ESTE TRABAJO FUE QUE QUIZAS PUDIESE DISCERNIRSE ENTRE LOS DOS MECANISMOS CITADOS ANTERIORMENTE EXAMINANDO LA VARIACION DE PROPIEDADES EN DISOLUCION CON EL PESO MOLECULAR O LA LONGITUD DE CONTORNO DEL ADN. ESTE ESTUDIOSE HA LLEVADO A CABO UTILIZANDO METODOS NUMERICOS DE SIMULACION TALES COMO EL METODO DE MONTE-CARLO Y EL TRATAMIENTO DE CUERPO RIGIDO . SE HAN UTILIZADO DOS MODELOS VERMIFORME Y ZIG-ZAG QUE DAN CUENTA DE LAS DOS POSIBILIDADES DE FLEXION. SE HAN CALCULADO VARIAS PROPIEDADES HIDRODINAMICAS EN FUNCION DE LA LONGITUD DE CADENA UTILIZANDO METODOS APROXIMADOS HACIENDO ESPECIAL ENFASIS EN EL DESARROLLO DEL CALCULO PARA EL COEFICIENTE DE DIFUSION ROTACIONAL PARA EL QUELA TEORIA NO ESTABA SUFICIENTEMENTE DESARROLLADA. EL METODO DE SIMULACION EMPLEADO ES VALIDO COMO SE HA COMPROBADO POR LA COINCIDENCIA EN LOS RESULTADOS OBTENIDOS CON LOS DE ALGUNOS MODELOS EXISTENTES EN LA BIBLIOGRAFIA Y POR LA REPRODUCCION DE LAS FUNCIONES DE DISTRIBUCION. A PESAR DE QUE LAS ESTADISTICAS PARA LOS DOS MODELOS SON DIFERENTES LOS VALORES OBTENIDOS PARA EL PARAMETRO A LONTIGUD DE PERSISTENCIA NO NOS PERMITEN DISCERNIR ACERCA DE QUE MODELO ES EL QUE MEJOR NOS EXPLICARIA LA FLEXIBILIDAD DEL ADN.