Identificación de proteínas de myxococcus xanthus que interaccionan con el factor transcripcional card

Resumen

La proteína CarD de Myxococcus xanthus es un regulador global de la transcripción. CarD participa en la regulación de la carotenogénesis y el desarrollo multicelular en M. xanthus. Además, CarD es necesario para la expresión de genes activos durante el crecimiento vegetativo. La proteína CarD presenta dos dominios: el dominio N-terminal, necesario para la función de la proteína, y el dominio C-terminal, que contiene un motivo de unión a DNA descrito previamente sólo en organismos eucarióticos. Las proteínas HMGA son necesarias para la formación de diversos complejos multiproteicos implicados en diversas operaciones sobre el DNA. La acción de HMGA está mediada tanto por su unión al DNA, que provoca cambios en su curvatura endógena, como por su interacción con distintas proteínas. El papel de CarD en la regulación de diversos grupos de genes en M. xanthus, y su similitud estructural y funcional con HMGA, llevan a la predicción de que CarD interacciona con distintas proteínas de M. xanthus implicadas en la regulación génica u otras operaciones sobre el DNA. En una de las estrategias de búsqueda de proteínas de M. xanthus que interaccionan con CarD se ha utilizado el sistema del doble híbrido de levaduras, para analizar la posible interacción física entre CarD y dos proteínas reguladoras de la carotenogénesis, IfhA y CarQ, y para rastrear una genoteca de fusiones traduccionales de la proteína presa a tramos de lectura abierta obtenidos al azar. Los plásmidos pGMx1 y pGMx2, identificados en esta búsqueda, son portadores de un fragmento de DNA cuyo producto interacciona específicamente con CarD. El orf incompleto contenido en pGMx1 no parece determinar realmente una proteína en M. xanthus. El orf truncado presente en pGMx2 muestra una gran similitud con el dominio citoplasmático de proteínas quinasas de histidina, de las que funcionan como proteínas sensoras en los sistemas reguladores de dos component